El puerto deportivo de Marsala cuenta con importantes referencias en la historia de nuestro país, pero no solo eso. Este puerto siempre ha atraído a los pueblos de los territorios vecinos por su ubicación estratégica en el Mediterráneo, ideal para el comercio. De hecho, la ciudad fue desde el principio un importante centro comercial. Tras la destrucción del puesto avanzado púnico de Mothia, los habitantes de la ciudad se instalaron en el promontorio de Lylibeo, situado justo enfrente, y desde allí retomaron sus actividades económicas.

El puerto de Lilibeo, al norte de la Ciudad, a la derecha del cabo Boeo, se convirtió ya desde el primer milenio a. C. en un paso obligado hacia África. Los fenicios, los cartagineses y los romanos atracaban en Marsala: Julio César, en el año 47 a. C., se refugió en Lilibeo, lugar de reunión de las legiones, pero también lo hizo Poncio Pilato en el año 31 a. C., durante su viaje a Palestina.

Su posición estratégica la convirtió en objeto de disputa entre cartagineses y romanos, hasta que estos últimos se impusieron con la victoria en la batalla de las Egadi en 241 a.C.

Tras su declive con el Imperio romano y tras ser saqueado por los vándalos, el puerto de Marsala volvió a florecer gracias al interés de los árabes, que valoraban tanto su ubicación y sus características que rebautizaron toda la ciudad como «puerto de Alí». La ciudad pasó a llamarse Marsa Alí, de donde viene su nombre actual. No fue hasta los siglos XIV y XV cuando el antiguo puerto de Lilibeo se convirtió en un centro de gran interés para españoles, franceses, otomanos y, por supuesto, piratas. Cerrado desde 1572 por orden de Juan de Austria, hijo del emperador Carlos V, que pensaba así alejar los intereses ajenos, el puerto permaneció inutilizable durante mucho tiempo.

Se produjo un nuevo impulso comercial gracias al interés de los ingleses por la tradición vinícola de la zona, lo que convirtió al puerto de Marsala en el punto de partida de una nueva e intensa actividad comercial. De hecho, en 1816, el comerciante inglés J. Woodhouse, interesado en la excelente calidad del vino local, mandó construir en la parte sur de la Ciudad un muelle de 800 metros para cargar las barricas en sus barcos. Esta obra se continuó más tarde gracias a una suscripción de los habitantes de Marsala, primero, y luego por el Decurionato en 1847, con el apoyo del gobierno borbónico.

El 11 de mayo de 1860, en el puerto de Marsala, entre los numerosos barcos británicos, se avistaron también las naves de Garibaldi y de los Mil, que desembarcaron aquí, en el mismo muelle construido por Woodhouse.

El puerto de Marsala es un puerto artificial rodeado por dos muelles costeros curvilíneos y un muelle exterior, con una entrada de 200 m de ancho. El muelle del este, donde pueden atracar barcos pequeños, mide 460 m de largo, de los cuales solo 50 m tienen muelles. En la parte sur del puerto también hay un puerto deportivo con capacidad para embarcaciones de hasta 35 m de eslora.

Este puerto deportivo tiene capacidad para 236 embarcaciones, 18 de ellas para tránsito, y una profundidad máxima de 4 metros. Una nota importante para los navegantes es que hay una boya a 5,5 millas al norte que marca el límite de las aguas seguras. El puerto deportivo cuenta actualmente con unas instalaciones funcionales, equipadas con muelles, anillas, postes de amarre y escaleras.

En 2014 se aprobó el proyecto definitivo para la creación del nuevo puerto deportivo Marina di Marsala, llevado a cabo por Marsala Yachting Resort srl, con la construcción de una instalación que contará con 1.036 amarres para yates de hasta 75 metros de eslora y una amplia oferta de servicios turísticos. Se trata de una obra destinada a realzar la imagen que este territorio, y en general Secilia, proyecta al mundo en cuanto a atractivo turístico.

El proyecto prevé, además, la remodelación de toda la dársena portuaria para reasignar los espacios adecuados a todas las actividades portuarias existentes. Además, se llevará a cabo una nueva ampliación de las obras de protección de la entrada al puerto y se aumentará la profundidad operativa de la zona de mercancías hasta los 7 metros.

Las embarcaciones más grandes tendrán a su disposición un Mega Dock exclusivo de 8 metros de ancho, equipado con todas las comodidades y seguridad. El repostaje de combustible se realiza en la cabecera del muelle de rompeolas, en una zona protegida y a la que las embarcaciones pueden acceder sin tener que dar rodeos. Entre los servicios adicionales de la Marina hay un astillero que se adapta tanto en tamaño como en características al plan de amarre, con más de 14 000 metros cuadrados de explanada y 800 metros cuadrados de nave, además de una rampa de varada y botadura de hasta 9 metros de ancho. Se espera que las obras del nuevo puerto terminen en 2017.