El Puerto Viejo de Porto Ercole da al mar Tirreno y está situado entre Punta dello Scoglione y el muelle de Santa Bárbara, que mide 315 metros de largo y cuenta con anillas de amarre. El Puerto Viejo se encuentra en la parte central de la zona más moderna de Porto Ercole.

Al norte del puerto hay dos promontorios sobre los que se alzan las antiguas fortificaciones de guardia del Fuerte Filippo y el Fuerte Santa Caterina; en el lado sur hay otro promontorio, sobre el que se construyó antiguamente la fortaleza aldobrandesca para proteger la ciudad y los puertos.

La zona de Porto Ercole está llena de historia: Porto Vecchio ya era un puerto estratégico de vital importancia en la Edad Media, primero para la familia Aldobrandeschi y luego para la República de Siena. Cuando, en el siglo XVI, Porto Ercole pasó a formar parte del Estado de los Presidios, los españoles mejoraron aún más la estructura del puerto y construyeron nuevos puestos de vigilancia en las colinas de los alrededores.

El puerto está formado por tres muelles: el Molo Sanità, el Molo delle Grotte y el Moletto delle Grotte. Los muelles están conectados entre sí por un embarcadero, el paseo marítimo Andrea Doria, del que parten 5 pontones flotantes, cedidos a particulares. Estos muelles ofrecen un total de 825 amarres, incluidos 2 reservados exclusivamente para el tránsito.

La eslora máxima permitida para las embarcaciones es de 24 metros cuando atracan en pantalanes y de 14 metros para las embarcaciones en tránsito.

El fondo marino, fangoso en el centro y rocoso cerca del espigón, varía mucho en profundidad: en la cuenca oscila entre un mínimo de 1,5 metros y un máximo de 7 metros, mientras que en el muelle la profundidad oscila entre 0,5 y 3 metros.

Entre los equipos mecánicos que hay dentro del puerto hay una grúa fija de hasta 5 toneladas y una grúa móvil de 25 toneladas. También hay un varadero con capacidad para hasta 500 t y una rampa de varada. En los puertos se hacen reparaciones eléctricas y electrónicas, de motores y de cascos de madera o fibra de vidrio. También se reparan velas.

En el muelle hay una gasolinera que ofrece gasolina, gasóleo y mezcla. Solo abre durante la temporada de verano, de 07:30 a 19:30. Hay 180 tomas de corriente y 10 tomas para mangueras. El suministro de agua solo está disponible de 18:00 a 22:00.

La banda de estribor y la cabeza del muelle de Grotte están reservadas exclusivamente a la Guardia Costera.

Los servicios de mantenimiento, vigilancia y recogida de residuos están garantizados.